Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP4Q96PP9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms