Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRC7Q96NW7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRC7Q96NW7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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