Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRRC1Q96M27 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PRRC1Q96M27 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms