Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PGLYRP3Q96LB9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PGLYRP3Q96LB9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PGLYRP3Q96LB9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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