Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms