Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF183Q96D59 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF183Q96D59 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms