Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM52Q96A61 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM52Q96A61 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms