Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CARMIL3Q8ND23 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CARMIL3Q8ND23 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms