Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC197Q8NCU1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms