Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SPC24Q8NBT2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms