Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATG16L2Q8NAA4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms