Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
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LRRC18Q8N456 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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LRRC18Q8N456 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRC18Q8N456 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms