Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNE4Q8N205 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNE4Q8N205 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms