Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CMTM1Q8IZ96 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms