Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME9Q86XW9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms