Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms