Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
STRCQ7RTU9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms