Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP31Q70CQ4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
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