Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC9Q6ZRR7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC9Q6ZRR7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms