Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZBED9Q6R2W3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZBED9Q6R2W3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
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