Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC137Q6PK04 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms