Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CREB3L3Q68CJ9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3L3Q68CJ9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms