Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GGNBP1Q5YKI7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GGNBP1Q5YKI7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GGNBP1Q5YKI7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GGNBP1Q5YKI7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GGNBP1Q5YKI7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms