Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SHEQ5VZ18 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms