Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LRRC38Q5VT99 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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LRRC38Q5VT99 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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LRRC38Q5VT99 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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LRRC38Q5VT99 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LRRC38Q5VT99 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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