Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOGA3Q5TF21 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms