Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SAMD9Q5K651 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SAMD9Q5K651 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms