Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAVIN4Q5BKX8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CAVIN4Q5BKX8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms