Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SDK2Q58EX2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SDK2Q58EX2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms