Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC93Q567U6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC93Q567U6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms