Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HSD17B12Q53GQ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms