Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPAT3Q53EU6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPAT3Q53EU6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms