Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SKOR2Q2VWA4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SKOR2Q2VWA4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms