Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ISXQ2M1V0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms