Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR3

QSER1, Glutamine and serine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QSER1Q2KHR3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
QSER1Q2KHR3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms