Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Q1T7F1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms