Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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PTPRNQ16849 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRNQ16849 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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