Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms