Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACKR1Q16570 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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