Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDC37Q16543 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms