Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GRIK5Q16478 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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