Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA2Q15822 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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