Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms