Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
BRD3Q15059 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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BRD3Q15059 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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BRD3Q15059 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BRD3Q15059 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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