Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HDM1Q15032 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HDM1Q15032 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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