Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CBX2Q14781 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CBX2Q14781 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms