Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RFTN1Q14699 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms