Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SMC1AQ14683 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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