Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HNF4GQ14541 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms