Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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TRIM25Q14258 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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